Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd4Q9CWX4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd4Q9CWX4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd4Q9CWX4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd4Q9CWX4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd4Q9CWX4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd4Q9CWX4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd4Q9CWX4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd4Q9CWX4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd4Q9CWX4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpusd4Q9CWX4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd4Q9CWX4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpusd4Q9CWX4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd4Q9CWX4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd4Q9CWX4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd4Q9CWX4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd4Q9CWX4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd4Q9CWX4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd4Q9CWX4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd4Q9CWX4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd4Q9CWX4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd4Q9CWX4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd4Q9CWX4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd4Q9CWX4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd4Q9CWX4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd4Q9CWX4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd4Q9CWX4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd4Q9CWX4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd4Q9CWX4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd4Q9CWX4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd4Q9CWX4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd4Q9CWX4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd4Q9CWX4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd4Q9CWX4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd4Q9CWX4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpusd4Q9CWX4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd4Q9CWX4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd4Q9CWX4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd4Q9CWX4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd4Q9CWX4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd4Q9CWX4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd4Q9CWX4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd4Q9CWX4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd4Q9CWX4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd4Q9CWX4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rpusd4Q9CWX4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rpusd4Q9CWX4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd4Q9CWX4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms