Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH1

Zbtb8a, Zinc finger and BTB domain-containing protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb8aQ9CWH1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb8aQ9CWH1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbtb8aQ9CWH1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb8aQ9CWH1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb8aQ9CWH1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb8aQ9CWH1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb8aQ9CWH1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb8aQ9CWH1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb8aQ9CWH1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb8aQ9CWH1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb8aQ9CWH1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb8aQ9CWH1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zbtb8aQ9CWH1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb8aQ9CWH1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb8aQ9CWH1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb8aQ9CWH1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb8aQ9CWH1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb8aQ9CWH1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zbtb8aQ9CWH1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8aQ9CWH1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb8aQ9CWH1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zbtb8aQ9CWH1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb8aQ9CWH1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb8aQ9CWH1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb8aQ9CWH1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb8aQ9CWH1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb8aQ9CWH1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb8aQ9CWH1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb8aQ9CWH1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb8aQ9CWH1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbtb8aQ9CWH1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbtb8aQ9CWH1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb8aQ9CWH1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb8aQ9CWH1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb8aQ9CWH1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb8aQ9CWH1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb8aQ9CWH1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb8aQ9CWH1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbtb8aQ9CWH1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbtb8aQ9CWH1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbtb8aQ9CWH1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zbtb8aQ9CWH1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbtb8aQ9CWH1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbtb8aQ9CWH1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbtb8aQ9CWH1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbtb8aQ9CWH1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbtb8aQ9CWH1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbtb8aQ9CWH1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbtb8aQ9CWH1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbtb8aQ9CWH1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbtb8aQ9CWH1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbtb8aQ9CWH1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb8aQ9CWH1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbtb8aQ9CWH1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb8aQ9CWH1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb8aQ9CWH1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb8aQ9CWH1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbtb8aQ9CWH1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb8aQ9CWH1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb8aQ9CWH1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbtb8aQ9CWH1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb8aQ9CWH1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbtb8aQ9CWH1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms