Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Filip1Q9CS72 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Filip1Q9CS72 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Filip1Q9CS72 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Filip1Q9CS72 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Filip1Q9CS72 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Filip1Q9CS72 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Filip1Q9CS72 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Filip1Q9CS72 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Filip1Q9CS72 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Filip1Q9CS72 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Filip1Q9CS72 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Filip1Q9CS72 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Filip1Q9CS72 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Filip1Q9CS72 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Filip1Q9CS72 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Filip1Q9CS72 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Filip1Q9CS72 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Filip1Q9CS72 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Filip1Q9CS72 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Filip1Q9CS72 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Filip1Q9CS72 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Filip1Q9CS72 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Filip1Q9CS72 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Filip1Q9CS72 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Filip1Q9CS72 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Filip1Q9CS72 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Filip1Q9CS72 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Filip1Q9CS72 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Filip1Q9CS72 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Filip1Q9CS72 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Filip1Q9CS72 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Filip1Q9CS72 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Filip1Q9CS72 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Filip1Q9CS72 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Filip1Q9CS72 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Filip1Q9CS72 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Filip1Q9CS72 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Filip1Q9CS72 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Filip1Q9CS72 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Filip1Q9CS72 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Filip1Q9CS72 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Filip1Q9CS72 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Filip1Q9CS72 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Filip1Q9CS72 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Filip1Q9CS72 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Filip1Q9CS72 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Filip1Q9CS72 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Filip1Q9CS72 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Filip1Q9CS72 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Filip1Q9CS72 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Filip1Q9CS72 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Filip1Q9CS72 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Filip1Q9CS72 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Filip1Q9CS72 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Filip1Q9CS72 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Filip1Q9CS72 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Filip1Q9CS72 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Filip1Q9CS72 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Filip1Q9CS72 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Filip1Q9CS72 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Filip1Q9CS72 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Filip1Q9CS72 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Filip1Q9CS72 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Filip1Q9CS72 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Filip1Q9CS72 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Filip1Q9CS72 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Filip1Q9CS72 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Filip1Q9CS72 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Filip1Q9CS72 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Filip1Q9CS72 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Filip1Q9CS72 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Filip1Q9CS72 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Filip1Q9CS72 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Filip1Q9CS72 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Filip1Q9CS72 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Filip1Q9CS72 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Filip1Q9CS72 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Filip1Q9CS72 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Filip1Q9CS72 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Filip1Q9CS72 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Filip1Q9CS72 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Filip1Q9CS72 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Filip1Q9CS72 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Filip1Q9CS72 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Filip1Q9CS72 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Filip1Q9CS72 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms