Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4931417E11RikQ9CR05 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4931417E11RikQ9CR05 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4931417E11RikQ9CR05 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4931417E11RikQ9CR05 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4931417E11RikQ9CR05 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4931417E11RikQ9CR05 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4931417E11RikQ9CR05 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4931417E11RikQ9CR05 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4931417E11RikQ9CR05 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4931417E11RikQ9CR05 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4931417E11RikQ9CR05 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4931417E11RikQ9CR05 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
4931417E11RikQ9CR05 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4931417E11RikQ9CR05 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
4931417E11RikQ9CR05 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
4931417E11RikQ9CR05 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4931417E11RikQ9CR05 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4931417E11RikQ9CR05 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4931417E11RikQ9CR05 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4931417E11RikQ9CR05 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4931417E11RikQ9CR05 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4931417E11RikQ9CR05 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4931417E11RikQ9CR05 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4931417E11RikQ9CR05 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
4931417E11RikQ9CR05 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4931417E11RikQ9CR05 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4931417E11RikQ9CR05 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931417E11RikQ9CR05 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4931417E11RikQ9CR05 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4931417E11RikQ9CR05 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4931417E11RikQ9CR05 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931417E11RikQ9CR05 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931417E11RikQ9CR05 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931417E11RikQ9CR05 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931417E11RikQ9CR05 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931417E11RikQ9CR05 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931417E11RikQ9CR05 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4931417E11RikQ9CR05 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4931417E11RikQ9CR05 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4931417E11RikQ9CR05 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931417E11RikQ9CR05 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931417E11RikQ9CR05 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4931417E11RikQ9CR05 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4931417E11RikQ9CR05 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4931417E11RikQ9CR05 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4931417E11RikQ9CR05 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
4931417E11RikQ9CR05 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931417E11RikQ9CR05 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931417E11RikQ9CR05 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.5 ms