Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mri1Q9CQT1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mri1Q9CQT1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mri1Q9CQT1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mri1Q9CQT1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mri1Q9CQT1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mri1Q9CQT1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mri1Q9CQT1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mri1Q9CQT1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mri1Q9CQT1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mri1Q9CQT1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mri1Q9CQT1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mri1Q9CQT1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mri1Q9CQT1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mri1Q9CQT1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mri1Q9CQT1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mri1Q9CQT1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mri1Q9CQT1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mri1Q9CQT1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mri1Q9CQT1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mri1Q9CQT1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mri1Q9CQT1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mri1Q9CQT1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mri1Q9CQT1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mri1Q9CQT1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mri1Q9CQT1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mri1Q9CQT1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mri1Q9CQT1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mri1Q9CQT1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mri1Q9CQT1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mri1Q9CQT1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mri1Q9CQT1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mri1Q9CQT1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mri1Q9CQT1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mri1Q9CQT1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mri1Q9CQT1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mri1Q9CQT1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mri1Q9CQT1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mri1Q9CQT1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mri1Q9CQT1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mri1Q9CQT1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mri1Q9CQT1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mri1Q9CQT1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mri1Q9CQT1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mri1Q9CQT1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Mri1Q9CQT1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mri1Q9CQT1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mri1Q9CQT1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mri1Q9CQT1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mri1Q9CQT1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mri1Q9CQT1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mri1Q9CQT1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Mri1Q9CQT1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mri1Q9CQT1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mri1Q9CQT1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mri1Q9CQT1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mri1Q9CQT1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mri1Q9CQT1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mri1Q9CQT1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mri1Q9CQT1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mri1Q9CQT1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mri1Q9CQT1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mri1Q9CQT1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms