Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm22Q9CQ85 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm22Q9CQ85 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm22Q9CQ85 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timm22Q9CQ85 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timm22Q9CQ85 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Timm22Q9CQ85 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Timm22Q9CQ85 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Timm22Q9CQ85 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Timm22Q9CQ85 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Timm22Q9CQ85 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Timm22Q9CQ85 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Timm22Q9CQ85 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Timm22Q9CQ85 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Timm22Q9CQ85 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Timm22Q9CQ85 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Timm22Q9CQ85 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Timm22Q9CQ85 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Timm22Q9CQ85 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Timm22Q9CQ85 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Timm22Q9CQ85 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Timm22Q9CQ85 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Timm22Q9CQ85 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Timm22Q9CQ85 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Timm22Q9CQ85 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Timm22Q9CQ85 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Timm22Q9CQ85 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Timm22Q9CQ85 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Timm22Q9CQ85 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Timm22Q9CQ85 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Timm22Q9CQ85 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Timm22Q9CQ85 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Timm22Q9CQ85 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Timm22Q9CQ85 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Timm22Q9CQ85 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Timm22Q9CQ85 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Timm22Q9CQ85 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Timm22Q9CQ85 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Timm22Q9CQ85 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Timm22Q9CQ85 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Timm22Q9CQ85 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Timm22Q9CQ85 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Timm22Q9CQ85 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Timm22Q9CQ85 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Timm22Q9CQ85 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Timm22Q9CQ85 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Timm22Q9CQ85 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm22Q9CQ85 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm22Q9CQ85 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm22Q9CQ85 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm22Q9CQ85 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm22Q9CQ85 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm22Q9CQ85 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Timm22Q9CQ85 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Timm22Q9CQ85 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm22Q9CQ85 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Timm22Q9CQ85 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Timm22Q9CQ85 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm22Q9CQ85 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm22Q9CQ85 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm22Q9CQ85 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timm22Q9CQ85 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timm22Q9CQ85 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Timm22Q9CQ85 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Timm22Q9CQ85 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Timm22Q9CQ85 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Timm22Q9CQ85 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Timm22Q9CQ85 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms