Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4921530L21RikQ9CQ47 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4921530L21RikQ9CQ47 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
4921530L21RikQ9CQ47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4921530L21RikQ9CQ47 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4921530L21RikQ9CQ47 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4921530L21RikQ9CQ47 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4921530L21RikQ9CQ47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4921530L21RikQ9CQ47 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4921530L21RikQ9CQ47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4921530L21RikQ9CQ47 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4921530L21RikQ9CQ47 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4921530L21RikQ9CQ47 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4921530L21RikQ9CQ47 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4921530L21RikQ9CQ47 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4921530L21RikQ9CQ47 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4921530L21RikQ9CQ47 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4921530L21RikQ9CQ47 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4921530L21RikQ9CQ47 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms