Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NenfQ9CQ45 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NenfQ9CQ45 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NenfQ9CQ45 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NenfQ9CQ45 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NenfQ9CQ45 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NenfQ9CQ45 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NenfQ9CQ45 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NenfQ9CQ45 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NenfQ9CQ45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NenfQ9CQ45 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NenfQ9CQ45 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NenfQ9CQ45 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NenfQ9CQ45 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NenfQ9CQ45 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NenfQ9CQ45 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NenfQ9CQ45 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NenfQ9CQ45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NenfQ9CQ45 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NenfQ9CQ45 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NenfQ9CQ45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NenfQ9CQ45 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NenfQ9CQ45 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NenfQ9CQ45 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NenfQ9CQ45 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NenfQ9CQ45 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NenfQ9CQ45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NenfQ9CQ45 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NenfQ9CQ45 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NenfQ9CQ45 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NenfQ9CQ45 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NenfQ9CQ45 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NenfQ9CQ45 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NenfQ9CQ45 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NenfQ9CQ45 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NenfQ9CQ45 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NenfQ9CQ45 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NenfQ9CQ45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NenfQ9CQ45 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NenfQ9CQ45 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NenfQ9CQ45 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NenfQ9CQ45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NenfQ9CQ45 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NenfQ9CQ45 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NenfQ9CQ45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NenfQ9CQ45 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NenfQ9CQ45 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NenfQ9CQ45 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NenfQ9CQ45 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NenfQ9CQ45 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NenfQ9CQ45 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NenfQ9CQ45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NenfQ9CQ45 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NenfQ9CQ45 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NenfQ9CQ45 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NenfQ9CQ45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NenfQ9CQ45 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NenfQ9CQ45 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NenfQ9CQ45 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NenfQ9CQ45 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NenfQ9CQ45 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NenfQ9CQ45 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NenfQ9CQ45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NenfQ9CQ45 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NenfQ9CQ45 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NenfQ9CQ45 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NenfQ9CQ45 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NenfQ9CQ45 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NenfQ9CQ45 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NenfQ9CQ45 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NenfQ9CQ45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NenfQ9CQ45 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NenfQ9CQ45 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NenfQ9CQ45 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NenfQ9CQ45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NenfQ9CQ45 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NenfQ9CQ45 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NenfQ9CQ45 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NenfQ9CQ45 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NenfQ9CQ45 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NenfQ9CQ45 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms