Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU8

Dhx30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx30Q99PU8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Dhx30Q99PU8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Dhx30Q99PU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Dhx30Q99PU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dhx30Q99PU8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dhx30Q99PU8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dhx30Q99PU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dhx30Q99PU8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Dhx30Q99PU8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dhx30Q99PU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Dhx30Q99PU8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Dhx30Q99PU8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Dhx30Q99PU8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dhx30Q99PU8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dhx30Q99PU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dhx30Q99PU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dhx30Q99PU8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dhx30Q99PU8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dhx30Q99PU8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dhx30Q99PU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dhx30Q99PU8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dhx30Q99PU8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dhx30Q99PU8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Dhx30Q99PU8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dhx30Q99PU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dhx30Q99PU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dhx30Q99PU8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dhx30Q99PU8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dhx30Q99PU8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dhx30Q99PU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dhx30Q99PU8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dhx30Q99PU8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Dhx30Q99PU8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dhx30Q99PU8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dhx30Q99PU8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dhx30Q99PU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dhx30Q99PU8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dhx30Q99PU8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Dhx30Q99PU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dhx30Q99PU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dhx30Q99PU8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dhx30Q99PU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dhx30Q99PU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Dhx30Q99PU8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dhx30Q99PU8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Dhx30Q99PU8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dhx30Q99PU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dhx30Q99PU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dhx30Q99PU8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dhx30Q99PU8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dhx30Q99PU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dhx30Q99PU8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dhx30Q99PU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dhx30Q99PU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dhx30Q99PU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dhx30Q99PU8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dhx30Q99PU8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dhx30Q99PU8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dhx30Q99PU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dhx30Q99PU8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dhx30Q99PU8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dhx30Q99PU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dhx30Q99PU8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dhx30Q99PU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dhx30Q99PU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dhx30Q99PU8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dhx30Q99PU8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dhx30Q99PU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dhx30Q99PU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dhx30Q99PU8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dhx30Q99PU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dhx30Q99PU8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dhx30Q99PU8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dhx30Q99PU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dhx30Q99PU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Dhx30Q99PU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dhx30Q99PU8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dhx30Q99PU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dhx30Q99PU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dhx30Q99PU8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dhx30Q99PU8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dhx30Q99PU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms