Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prss29Q99MS4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prss29Q99MS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prss29Q99MS4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms