Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prss29Q99MS4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prss29Q99MS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prss29Q99MS4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prss29Q99MS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prss29Q99MS4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prss29Q99MS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prss29Q99MS4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss29Q99MS4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss29Q99MS4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss29Q99MS4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss29Q99MS4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms