Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME7

Tbx19, T-box transcription factor TBX19, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx19Q99ME7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx19Q99ME7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbx19Q99ME7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbx19Q99ME7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx19Q99ME7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx19Q99ME7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbx19Q99ME7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbx19Q99ME7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx19Q99ME7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbx19Q99ME7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbx19Q99ME7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tbx19Q99ME7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tbx19Q99ME7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tbx19Q99ME7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx19Q99ME7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx19Q99ME7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tbx19Q99ME7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tbx19Q99ME7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx19Q99ME7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx19Q99ME7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx19Q99ME7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx19Q99ME7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx19Q99ME7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tbx19Q99ME7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tbx19Q99ME7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tbx19Q99ME7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx19Q99ME7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx19Q99ME7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tbx19Q99ME7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx19Q99ME7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx19Q99ME7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx19Q99ME7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx19Q99ME7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx19Q99ME7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx19Q99ME7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tbx19Q99ME7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tbx19Q99ME7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx19Q99ME7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tbx19Q99ME7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tbx19Q99ME7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tbx19Q99ME7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tbx19Q99ME7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tbx19Q99ME7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbx19Q99ME7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbx19Q99ME7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbx19Q99ME7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbx19Q99ME7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbx19Q99ME7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbx19Q99ME7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbx19Q99ME7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbx19Q99ME7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbx19Q99ME7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms