Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcf19Q99KJ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcf19Q99KJ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcf19Q99KJ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf19Q99KJ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf19Q99KJ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf19Q99KJ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf19Q99KJ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcf19Q99KJ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf19Q99KJ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf19Q99KJ5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tcf19Q99KJ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf19Q99KJ5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf19Q99KJ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf19Q99KJ5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf19Q99KJ5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf19Q99KJ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcf19Q99KJ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf19Q99KJ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf19Q99KJ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf19Q99KJ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf19Q99KJ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf19Q99KJ5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcf19Q99KJ5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcf19Q99KJ5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcf19Q99KJ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcf19Q99KJ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcf19Q99KJ5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcf19Q99KJ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcf19Q99KJ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcf19Q99KJ5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcf19Q99KJ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcf19Q99KJ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcf19Q99KJ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcf19Q99KJ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf19Q99KJ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf19Q99KJ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcf19Q99KJ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcf19Q99KJ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcf19Q99KJ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcf19Q99KJ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcf19Q99KJ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcf19Q99KJ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcf19Q99KJ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcf19Q99KJ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf19Q99KJ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf19Q99KJ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tcf19Q99KJ5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcf19Q99KJ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf19Q99KJ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf19Q99KJ5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcf19Q99KJ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf19Q99KJ5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf19Q99KJ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf19Q99KJ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcf19Q99KJ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf19Q99KJ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcf19Q99KJ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf19Q99KJ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms