Protein–RNA interactions for Protein: Q99K99

Uncharacterized protein C4orf19 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99K99 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q99K99 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q99K99 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q99K99 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Q99K99 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q99K99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q99K99 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q99K99 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q99K99 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q99K99 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q99K99 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q99K99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q99K99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q99K99 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q99K99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q99K99 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q99K99 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q99K99 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q99K99 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q99K99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q99K99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q99K99 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q99K99 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q99K99 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q99K99 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q99K99 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q99K99 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q99K99 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q99K99 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q99K99 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q99K99 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q99K99 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q99K99 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q99K99 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q99K99 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q99K99 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q99K99 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q99K99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q99K99 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q99K99 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q99K99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q99K99 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q99K99 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q99K99 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q99K99 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q99K99 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q99K99 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q99K99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q99K99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q99K99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q99K99 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q99K99 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q99K99 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q99K99 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q99K99 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q99K99 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q99K99 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q99K99 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99K99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99K99 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99K99 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q99K99 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q99K99 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q99K99 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q99K99 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q99K99 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q99K99 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q99K99 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q99K99 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Q99K99 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q99K99 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q99K99 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q99K99 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q99K99 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q99K99 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q99K99 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q99K99 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q99K99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q99K99 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q99K99 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q99K99 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q99K99 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99K99 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99K99 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99K99 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99K99 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99K99 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q99K99 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q99K99 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q99K99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q99K99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q99K99 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q99K99 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q99K99 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q99K99 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q99K99 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q99K99 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q99K99 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q99K99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q99K99 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms