Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lims1Q99JW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims1Q99JW4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims1Q99JW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims1Q99JW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lims1Q99JW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lims1Q99JW4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lims1Q99JW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lims1Q99JW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lims1Q99JW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lims1Q99JW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lims1Q99JW4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lims1Q99JW4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lims1Q99JW4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lims1Q99JW4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lims1Q99JW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lims1Q99JW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lims1Q99JW4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lims1Q99JW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lims1Q99JW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lims1Q99JW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lims1Q99JW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lims1Q99JW4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lims1Q99JW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lims1Q99JW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lims1Q99JW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lims1Q99JW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lims1Q99JW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lims1Q99JW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lims1Q99JW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lims1Q99JW4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lims1Q99JW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lims1Q99JW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lims1Q99JW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lims1Q99JW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lims1Q99JW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lims1Q99JW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lims1Q99JW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lims1Q99JW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lims1Q99JW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lims1Q99JW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lims1Q99JW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lims1Q99JW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lims1Q99JW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lims1Q99JW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lims1Q99JW4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lims1Q99JW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lims1Q99JW4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lims1Q99JW4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lims1Q99JW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms