Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CsprsQ99388 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CsprsQ99388 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CsprsQ99388 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CsprsQ99388 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CsprsQ99388 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CsprsQ99388 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CsprsQ99388 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CsprsQ99388 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CsprsQ99388 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CsprsQ99388 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CsprsQ99388 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CsprsQ99388 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CsprsQ99388 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CsprsQ99388 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CsprsQ99388 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CsprsQ99388 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CsprsQ99388 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CsprsQ99388 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CsprsQ99388 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CsprsQ99388 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CsprsQ99388 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CsprsQ99388 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CsprsQ99388 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CsprsQ99388 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CsprsQ99388 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CsprsQ99388 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CsprsQ99388 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CsprsQ99388 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CsprsQ99388 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CsprsQ99388 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CsprsQ99388 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CsprsQ99388 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CsprsQ99388 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CsprsQ99388 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CsprsQ99388 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CsprsQ99388 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CsprsQ99388 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CsprsQ99388 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CsprsQ99388 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CsprsQ99388 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CsprsQ99388 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CsprsQ99388 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CsprsQ99388 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CsprsQ99388 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CsprsQ99388 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CsprsQ99388 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CsprsQ99388 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CsprsQ99388 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CsprsQ99388 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms