Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tom1l1Q923U0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tom1l1Q923U0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tom1l1Q923U0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tom1l1Q923U0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tom1l1Q923U0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tom1l1Q923U0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tom1l1Q923U0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1l1Q923U0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1l1Q923U0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tom1l1Q923U0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tom1l1Q923U0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tom1l1Q923U0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tom1l1Q923U0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tom1l1Q923U0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tom1l1Q923U0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tom1l1Q923U0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tom1l1Q923U0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tom1l1Q923U0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tom1l1Q923U0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tom1l1Q923U0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tom1l1Q923U0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tom1l1Q923U0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tom1l1Q923U0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tom1l1Q923U0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Tom1l1Q923U0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tom1l1Q923U0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tom1l1Q923U0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tom1l1Q923U0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1l1Q923U0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tom1l1Q923U0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tom1l1Q923U0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tom1l1Q923U0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tom1l1Q923U0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tom1l1Q923U0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tom1l1Q923U0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tom1l1Q923U0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tom1l1Q923U0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tom1l1Q923U0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1l1Q923U0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tom1l1Q923U0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tom1l1Q923U0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tom1l1Q923U0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tom1l1Q923U0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tom1l1Q923U0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tom1l1Q923U0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tom1l1Q923U0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1l1Q923U0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tom1l1Q923U0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1l1Q923U0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tom1l1Q923U0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tom1l1Q923U0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tom1l1Q923U0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tom1l1Q923U0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tom1l1Q923U0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tom1l1Q923U0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tom1l1Q923U0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tom1l1Q923U0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1l1Q923U0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tom1l1Q923U0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tom1l1Q923U0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tom1l1Q923U0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tom1l1Q923U0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tom1l1Q923U0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tom1l1Q923U0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tom1l1Q923U0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tom1l1Q923U0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tom1l1Q923U0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tom1l1Q923U0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tom1l1Q923U0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tom1l1Q923U0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tom1l1Q923U0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1l1Q923U0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1l1Q923U0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1l1Q923U0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tom1l1Q923U0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tom1l1Q923U0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tom1l1Q923U0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tom1l1Q923U0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tom1l1Q923U0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms