Protein–RNA interactions for Protein: Q921B4

Nrif2, Neurotrophin receptor-interacting factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif2Q921B4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrif2Q921B4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrif2Q921B4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrif2Q921B4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrif2Q921B4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrif2Q921B4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrif2Q921B4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrif2Q921B4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrif2Q921B4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrif2Q921B4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrif2Q921B4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrif2Q921B4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrif2Q921B4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrif2Q921B4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrif2Q921B4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrif2Q921B4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrif2Q921B4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrif2Q921B4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrif2Q921B4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrif2Q921B4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrif2Q921B4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrif2Q921B4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrif2Q921B4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrif2Q921B4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrif2Q921B4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrif2Q921B4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrif2Q921B4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrif2Q921B4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrif2Q921B4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrif2Q921B4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrif2Q921B4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrif2Q921B4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrif2Q921B4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrif2Q921B4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrif2Q921B4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrif2Q921B4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrif2Q921B4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrif2Q921B4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrif2Q921B4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrif2Q921B4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrif2Q921B4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrif2Q921B4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrif2Q921B4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrif2Q921B4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrif2Q921B4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrif2Q921B4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrif2Q921B4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrif2Q921B4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrif2Q921B4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrif2Q921B4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrif2Q921B4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrif2Q921B4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrif2Q921B4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif2Q921B4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrif2Q921B4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrif2Q921B4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif2Q921B4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif2Q921B4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrif2Q921B4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrif2Q921B4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrif2Q921B4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrif2Q921B4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrif2Q921B4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrif2Q921B4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrif2Q921B4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrif2Q921B4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms