Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx15Q91WE1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx15Q91WE1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx15Q91WE1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx15Q91WE1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx15Q91WE1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx15Q91WE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx15Q91WE1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx15Q91WE1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx15Q91WE1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx15Q91WE1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx15Q91WE1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx15Q91WE1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx15Q91WE1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx15Q91WE1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx15Q91WE1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx15Q91WE1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx15Q91WE1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx15Q91WE1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx15Q91WE1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx15Q91WE1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx15Q91WE1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx15Q91WE1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx15Q91WE1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx15Q91WE1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx15Q91WE1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx15Q91WE1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx15Q91WE1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx15Q91WE1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx15Q91WE1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx15Q91WE1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx15Q91WE1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx15Q91WE1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx15Q91WE1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx15Q91WE1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx15Q91WE1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx15Q91WE1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx15Q91WE1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx15Q91WE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx15Q91WE1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snx15Q91WE1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx15Q91WE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx15Q91WE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx15Q91WE1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx15Q91WE1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx15Q91WE1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx15Q91WE1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx15Q91WE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx15Q91WE1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx15Q91WE1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx15Q91WE1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx15Q91WE1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx15Q91WE1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx15Q91WE1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms