Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ankrd49Q8VE42 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ankrd49Q8VE42 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ankrd49Q8VE42 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ankrd49Q8VE42 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ankrd49Q8VE42 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ankrd49Q8VE42 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ankrd49Q8VE42 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ankrd49Q8VE42 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ankrd49Q8VE42 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ankrd49Q8VE42 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ankrd49Q8VE42 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ankrd49Q8VE42 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ankrd49Q8VE42 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ankrd49Q8VE42 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ankrd49Q8VE42 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ankrd49Q8VE42 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ankrd49Q8VE42 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ankrd49Q8VE42 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ankrd49Q8VE42 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ankrd49Q8VE42 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ankrd49Q8VE42 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ankrd49Q8VE42 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ankrd49Q8VE42 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ankrd49Q8VE42 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ankrd49Q8VE42 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ankrd49Q8VE42 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ankrd49Q8VE42 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ankrd49Q8VE42 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ankrd49Q8VE42 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd49Q8VE42 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ankrd49Q8VE42 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ankrd49Q8VE42 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ankrd49Q8VE42 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd49Q8VE42 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd49Q8VE42 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd49Q8VE42 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd49Q8VE42 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd49Q8VE42 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ankrd49Q8VE42 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ankrd49Q8VE42 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ankrd49Q8VE42 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ankrd49Q8VE42 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ankrd49Q8VE42 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ankrd49Q8VE42 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ankrd49Q8VE42 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ankrd49Q8VE42 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd49Q8VE42 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd49Q8VE42 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ankrd49Q8VE42 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ankrd49Q8VE42 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ankrd49Q8VE42 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ankrd49Q8VE42 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ankrd49Q8VE42 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ankrd49Q8VE42 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ankrd49Q8VE42 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ankrd49Q8VE42 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ankrd49Q8VE42 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ankrd49Q8VE42 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ankrd49Q8VE42 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ankrd49Q8VE42 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ankrd49Q8VE42 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ankrd49Q8VE42 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd49Q8VE42 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd49Q8VE42 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ankrd49Q8VE42 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ankrd49Q8VE42 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ankrd49Q8VE42 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ankrd49Q8VE42 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ankrd49Q8VE42 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms