Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam20bQ8VCS3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam20bQ8VCS3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam20bQ8VCS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam20bQ8VCS3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20bQ8VCS3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam20bQ8VCS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam20bQ8VCS3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam20bQ8VCS3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam20bQ8VCS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20bQ8VCS3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam20bQ8VCS3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam20bQ8VCS3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20bQ8VCS3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20bQ8VCS3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20bQ8VCS3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam20bQ8VCS3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam20bQ8VCS3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam20bQ8VCS3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam20bQ8VCS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam20bQ8VCS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20bQ8VCS3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20bQ8VCS3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20bQ8VCS3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20bQ8VCS3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam20bQ8VCS3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam20bQ8VCS3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam20bQ8VCS3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam20bQ8VCS3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20bQ8VCS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20bQ8VCS3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20bQ8VCS3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam20bQ8VCS3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam20bQ8VCS3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam20bQ8VCS3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam20bQ8VCS3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam20bQ8VCS3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam20bQ8VCS3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam20bQ8VCS3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam20bQ8VCS3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam20bQ8VCS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam20bQ8VCS3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam20bQ8VCS3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam20bQ8VCS3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20bQ8VCS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20bQ8VCS3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20bQ8VCS3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam20bQ8VCS3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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