Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a8Q8R4D1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a8Q8R4D1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a8Q8R4D1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a8Q8R4D1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc9a8Q8R4D1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a8Q8R4D1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a8Q8R4D1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc9a8Q8R4D1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc9a8Q8R4D1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc9a8Q8R4D1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9a8Q8R4D1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a8Q8R4D1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a8Q8R4D1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a8Q8R4D1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc9a8Q8R4D1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a8Q8R4D1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a8Q8R4D1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a8Q8R4D1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9a8Q8R4D1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9a8Q8R4D1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a8Q8R4D1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a8Q8R4D1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a8Q8R4D1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a8Q8R4D1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a8Q8R4D1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc9a8Q8R4D1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a8Q8R4D1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a8Q8R4D1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a8Q8R4D1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc9a8Q8R4D1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc9a8Q8R4D1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a8Q8R4D1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a8Q8R4D1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a8Q8R4D1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a8Q8R4D1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a8Q8R4D1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a8Q8R4D1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a8Q8R4D1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a8Q8R4D1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a8Q8R4D1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a8Q8R4D1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a8Q8R4D1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a8Q8R4D1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a8Q8R4D1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a8Q8R4D1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a8Q8R4D1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a8Q8R4D1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a8Q8R4D1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a8Q8R4D1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a8Q8R4D1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc9a8Q8R4D1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a8Q8R4D1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a8Q8R4D1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a8Q8R4D1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a8Q8R4D1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a8Q8R4D1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a8Q8R4D1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc9a8Q8R4D1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a8Q8R4D1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a8Q8R4D1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a8Q8R4D1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a8Q8R4D1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a8Q8R4D1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a8Q8R4D1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9a8Q8R4D1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a8Q8R4D1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms