Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp4Q8R2N2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp4Q8R2N2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp4Q8R2N2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp4Q8R2N2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp4Q8R2N2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp4Q8R2N2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp4Q8R2N2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp4Q8R2N2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp4Q8R2N2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp4Q8R2N2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp4Q8R2N2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Utp4Q8R2N2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp4Q8R2N2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp4Q8R2N2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp4Q8R2N2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp4Q8R2N2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Utp4Q8R2N2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp4Q8R2N2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp4Q8R2N2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp4Q8R2N2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Utp4Q8R2N2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Utp4Q8R2N2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Utp4Q8R2N2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Utp4Q8R2N2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Utp4Q8R2N2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Utp4Q8R2N2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Utp4Q8R2N2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Utp4Q8R2N2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Utp4Q8R2N2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Utp4Q8R2N2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Utp4Q8R2N2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp4Q8R2N2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp4Q8R2N2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp4Q8R2N2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Utp4Q8R2N2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Utp4Q8R2N2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp4Q8R2N2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Utp4Q8R2N2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp4Q8R2N2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Utp4Q8R2N2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Utp4Q8R2N2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Utp4Q8R2N2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Utp4Q8R2N2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Utp4Q8R2N2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Utp4Q8R2N2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Utp4Q8R2N2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Utp4Q8R2N2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp4Q8R2N2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp4Q8R2N2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Utp4Q8R2N2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp4Q8R2N2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp4Q8R2N2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Utp4Q8R2N2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Utp4Q8R2N2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Utp4Q8R2N2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Utp4Q8R2N2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp4Q8R2N2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Utp4Q8R2N2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Utp4Q8R2N2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Utp4Q8R2N2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp4Q8R2N2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp4Q8R2N2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp4Q8R2N2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp4Q8R2N2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp4Q8R2N2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp4Q8R2N2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp4Q8R2N2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Utp4Q8R2N2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms