Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpv3Q8K424 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpv3Q8K424 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpv3Q8K424 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpv3Q8K424 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpv3Q8K424 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpv3Q8K424 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv3Q8K424 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpv3Q8K424 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpv3Q8K424 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpv3Q8K424 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpv3Q8K424 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpv3Q8K424 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpv3Q8K424 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpv3Q8K424 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpv3Q8K424 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpv3Q8K424 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpv3Q8K424 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpv3Q8K424 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpv3Q8K424 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpv3Q8K424 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpv3Q8K424 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpv3Q8K424 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpv3Q8K424 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpv3Q8K424 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpv3Q8K424 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpv3Q8K424 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpv3Q8K424 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpv3Q8K424 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv3Q8K424 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpv3Q8K424 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv3Q8K424 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv3Q8K424 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv3Q8K424 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpv3Q8K424 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv3Q8K424 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv3Q8K424 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv3Q8K424 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv3Q8K424 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpv3Q8K424 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpv3Q8K424 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv3Q8K424 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv3Q8K424 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv3Q8K424 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv3Q8K424 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv3Q8K424 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv3Q8K424 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv3Q8K424 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv3Q8K424 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpv3Q8K424 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpv3Q8K424 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv3Q8K424 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpv3Q8K424 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv3Q8K424 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv3Q8K424 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv3Q8K424 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpv3Q8K424 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpv3Q8K424 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv3Q8K424 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv3Q8K424 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv3Q8K424 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv3Q8K424 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv3Q8K424 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv3Q8K424 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv3Q8K424 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms