Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2B3

Sdha, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhaQ8K2B3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdhaQ8K2B3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdhaQ8K2B3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SdhaQ8K2B3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SdhaQ8K2B3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SdhaQ8K2B3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SdhaQ8K2B3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhaQ8K2B3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SdhaQ8K2B3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SdhaQ8K2B3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SdhaQ8K2B3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SdhaQ8K2B3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SdhaQ8K2B3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SdhaQ8K2B3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SdhaQ8K2B3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SdhaQ8K2B3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SdhaQ8K2B3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdhaQ8K2B3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdhaQ8K2B3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SdhaQ8K2B3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SdhaQ8K2B3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdhaQ8K2B3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdhaQ8K2B3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SdhaQ8K2B3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SdhaQ8K2B3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SdhaQ8K2B3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SdhaQ8K2B3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SdhaQ8K2B3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SdhaQ8K2B3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SdhaQ8K2B3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SdhaQ8K2B3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SdhaQ8K2B3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SdhaQ8K2B3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SdhaQ8K2B3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SdhaQ8K2B3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SdhaQ8K2B3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SdhaQ8K2B3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhaQ8K2B3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SdhaQ8K2B3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SdhaQ8K2B3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SdhaQ8K2B3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhaQ8K2B3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SdhaQ8K2B3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdhaQ8K2B3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SdhaQ8K2B3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SdhaQ8K2B3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SdhaQ8K2B3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms