Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1N2

Phldb2, Pleckstrin homology-like domain family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb2Q8K1N2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Phldb2Q8K1N2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Phldb2Q8K1N2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Phldb2Q8K1N2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Phldb2Q8K1N2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Phldb2Q8K1N2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Phldb2Q8K1N2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Phldb2Q8K1N2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Phldb2Q8K1N2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Phldb2Q8K1N2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Phldb2Q8K1N2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Phldb2Q8K1N2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Phldb2Q8K1N2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Phldb2Q8K1N2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Phldb2Q8K1N2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Phldb2Q8K1N2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Phldb2Q8K1N2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Phldb2Q8K1N2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Phldb2Q8K1N2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Phldb2Q8K1N2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Phldb2Q8K1N2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Phldb2Q8K1N2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Phldb2Q8K1N2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Phldb2Q8K1N2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Phldb2Q8K1N2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,83■■■□□ 2,2
Phldb2Q8K1N2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Phldb2Q8K1N2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Phldb2Q8K1N2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Phldb2Q8K1N2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Phldb2Q8K1N2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Phldb2Q8K1N2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Phldb2Q8K1N2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Phldb2Q8K1N2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Phldb2Q8K1N2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Phldb2Q8K1N2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Phldb2Q8K1N2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Phldb2Q8K1N2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Phldb2Q8K1N2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Phldb2Q8K1N2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Phldb2Q8K1N2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Phldb2Q8K1N2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Phldb2Q8K1N2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Phldb2Q8K1N2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Phldb2Q8K1N2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Phldb2Q8K1N2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Phldb2Q8K1N2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Phldb2Q8K1N2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Phldb2Q8K1N2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Phldb2Q8K1N2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Phldb2Q8K1N2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Phldb2Q8K1N2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Phldb2Q8K1N2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Phldb2Q8K1N2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,12
Phldb2Q8K1N2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Phldb2Q8K1N2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Phldb2Q8K1N2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Phldb2Q8K1N2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Phldb2Q8K1N2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Phldb2Q8K1N2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Phldb2Q8K1N2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Phldb2Q8K1N2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Phldb2Q8K1N2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Phldb2Q8K1N2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Phldb2Q8K1N2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Phldb2Q8K1N2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Phldb2Q8K1N2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Phldb2Q8K1N2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Phldb2Q8K1N2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Phldb2Q8K1N2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Phldb2Q8K1N2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms