Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1H7

Tcp11l2, T-complex protein 11-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11l2Q8K1H7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcp11l2Q8K1H7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tcp11l2Q8K1H7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcp11l2Q8K1H7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tcp11l2Q8K1H7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tcp11l2Q8K1H7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tcp11l2Q8K1H7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcp11l2Q8K1H7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcp11l2Q8K1H7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tcp11l2Q8K1H7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tcp11l2Q8K1H7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcp11l2Q8K1H7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tcp11l2Q8K1H7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tcp11l2Q8K1H7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tcp11l2Q8K1H7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tcp11l2Q8K1H7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tcp11l2Q8K1H7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcp11l2Q8K1H7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcp11l2Q8K1H7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcp11l2Q8K1H7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tcp11l2Q8K1H7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcp11l2Q8K1H7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcp11l2Q8K1H7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcp11l2Q8K1H7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcp11l2Q8K1H7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcp11l2Q8K1H7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp11l2Q8K1H7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcp11l2Q8K1H7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tcp11l2Q8K1H7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcp11l2Q8K1H7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcp11l2Q8K1H7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcp11l2Q8K1H7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcp11l2Q8K1H7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcp11l2Q8K1H7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcp11l2Q8K1H7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tcp11l2Q8K1H7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tcp11l2Q8K1H7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tcp11l2Q8K1H7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcp11l2Q8K1H7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcp11l2Q8K1H7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tcp11l2Q8K1H7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tcp11l2Q8K1H7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tcp11l2Q8K1H7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tcp11l2Q8K1H7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcp11l2Q8K1H7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tcp11l2Q8K1H7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tcp11l2Q8K1H7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tcp11l2Q8K1H7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tcp11l2Q8K1H7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tcp11l2Q8K1H7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tcp11l2Q8K1H7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tcp11l2Q8K1H7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tcp11l2Q8K1H7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tcp11l2Q8K1H7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tcp11l2Q8K1H7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tcp11l2Q8K1H7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tcp11l2Q8K1H7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Tcp11l2Q8K1H7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcp11l2Q8K1H7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcp11l2Q8K1H7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcp11l2Q8K1H7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tcp11l2Q8K1H7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tcp11l2Q8K1H7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tcp11l2Q8K1H7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tcp11l2Q8K1H7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tcp11l2Q8K1H7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tcp11l2Q8K1H7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tcp11l2Q8K1H7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcp11l2Q8K1H7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tcp11l2Q8K1H7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcp11l2Q8K1H7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcp11l2Q8K1H7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcp11l2Q8K1H7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcp11l2Q8K1H7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcp11l2Q8K1H7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcp11l2Q8K1H7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcp11l2Q8K1H7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcp11l2Q8K1H7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcp11l2Q8K1H7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcp11l2Q8K1H7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcp11l2Q8K1H7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tcp11l2Q8K1H7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcp11l2Q8K1H7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcp11l2Q8K1H7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tcp11l2Q8K1H7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tcp11l2Q8K1H7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcp11l2Q8K1H7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tcp11l2Q8K1H7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tcp11l2Q8K1H7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tcp11l2Q8K1H7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tcp11l2Q8K1H7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tcp11l2Q8K1H7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tcp11l2Q8K1H7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcp11l2Q8K1H7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcp11l2Q8K1H7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcp11l2Q8K1H7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcp11l2Q8K1H7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcp11l2Q8K1H7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcp11l2Q8K1H7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcp11l2Q8K1H7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms