Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0P3

Tldc1, TLD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tldc1Q8K0P3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tldc1Q8K0P3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tldc1Q8K0P3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tldc1Q8K0P3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tldc1Q8K0P3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tldc1Q8K0P3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tldc1Q8K0P3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tldc1Q8K0P3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Tldc1Q8K0P3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tldc1Q8K0P3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tldc1Q8K0P3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tldc1Q8K0P3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tldc1Q8K0P3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tldc1Q8K0P3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tldc1Q8K0P3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tldc1Q8K0P3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tldc1Q8K0P3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tldc1Q8K0P3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tldc1Q8K0P3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tldc1Q8K0P3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tldc1Q8K0P3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tldc1Q8K0P3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tldc1Q8K0P3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tldc1Q8K0P3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tldc1Q8K0P3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tldc1Q8K0P3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tldc1Q8K0P3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tldc1Q8K0P3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tldc1Q8K0P3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tldc1Q8K0P3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tldc1Q8K0P3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Tldc1Q8K0P3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tldc1Q8K0P3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tldc1Q8K0P3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tldc1Q8K0P3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tldc1Q8K0P3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tldc1Q8K0P3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tldc1Q8K0P3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tldc1Q8K0P3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tldc1Q8K0P3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tldc1Q8K0P3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tldc1Q8K0P3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tldc1Q8K0P3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tldc1Q8K0P3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tldc1Q8K0P3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tldc1Q8K0P3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tldc1Q8K0P3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tldc1Q8K0P3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tldc1Q8K0P3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Tldc1Q8K0P3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tldc1Q8K0P3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tldc1Q8K0P3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tldc1Q8K0P3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tldc1Q8K0P3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tldc1Q8K0P3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tldc1Q8K0P3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tldc1Q8K0P3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tldc1Q8K0P3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tldc1Q8K0P3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tldc1Q8K0P3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tldc1Q8K0P3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms