Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZU6

Pxdc1, PX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pxdc1Q8JZU6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pxdc1Q8JZU6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pxdc1Q8JZU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pxdc1Q8JZU6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pxdc1Q8JZU6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pxdc1Q8JZU6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pxdc1Q8JZU6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pxdc1Q8JZU6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pxdc1Q8JZU6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pxdc1Q8JZU6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pxdc1Q8JZU6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pxdc1Q8JZU6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pxdc1Q8JZU6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pxdc1Q8JZU6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pxdc1Q8JZU6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pxdc1Q8JZU6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pxdc1Q8JZU6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pxdc1Q8JZU6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pxdc1Q8JZU6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pxdc1Q8JZU6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pxdc1Q8JZU6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pxdc1Q8JZU6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pxdc1Q8JZU6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pxdc1Q8JZU6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pxdc1Q8JZU6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pxdc1Q8JZU6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pxdc1Q8JZU6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pxdc1Q8JZU6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pxdc1Q8JZU6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pxdc1Q8JZU6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pxdc1Q8JZU6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pxdc1Q8JZU6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pxdc1Q8JZU6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pxdc1Q8JZU6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pxdc1Q8JZU6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pxdc1Q8JZU6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pxdc1Q8JZU6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pxdc1Q8JZU6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pxdc1Q8JZU6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pxdc1Q8JZU6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pxdc1Q8JZU6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pxdc1Q8JZU6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pxdc1Q8JZU6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pxdc1Q8JZU6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms