Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CopaQ8CIE6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CopaQ8CIE6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CopaQ8CIE6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CopaQ8CIE6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CopaQ8CIE6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CopaQ8CIE6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CopaQ8CIE6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CopaQ8CIE6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CopaQ8CIE6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CopaQ8CIE6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CopaQ8CIE6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CopaQ8CIE6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CopaQ8CIE6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CopaQ8CIE6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CopaQ8CIE6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CopaQ8CIE6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CopaQ8CIE6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CopaQ8CIE6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CopaQ8CIE6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CopaQ8CIE6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CopaQ8CIE6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CopaQ8CIE6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CopaQ8CIE6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CopaQ8CIE6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CopaQ8CIE6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CopaQ8CIE6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CopaQ8CIE6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CopaQ8CIE6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CopaQ8CIE6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CopaQ8CIE6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CopaQ8CIE6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CopaQ8CIE6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CopaQ8CIE6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CopaQ8CIE6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CopaQ8CIE6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CopaQ8CIE6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CopaQ8CIE6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CopaQ8CIE6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CopaQ8CIE6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CopaQ8CIE6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CopaQ8CIE6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CopaQ8CIE6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CopaQ8CIE6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CopaQ8CIE6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CopaQ8CIE6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CopaQ8CIE6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CopaQ8CIE6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CopaQ8CIE6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CopaQ8CIE6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CopaQ8CIE6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CopaQ8CIE6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CopaQ8CIE6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CopaQ8CIE6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CopaQ8CIE6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CopaQ8CIE6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CopaQ8CIE6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CopaQ8CIE6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CopaQ8CIE6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CopaQ8CIE6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CopaQ8CIE6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CopaQ8CIE6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CopaQ8CIE6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CopaQ8CIE6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CopaQ8CIE6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CopaQ8CIE6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CopaQ8CIE6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CopaQ8CIE6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CopaQ8CIE6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CopaQ8CIE6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CopaQ8CIE6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CopaQ8CIE6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CopaQ8CIE6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CopaQ8CIE6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CopaQ8CIE6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CopaQ8CIE6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CopaQ8CIE6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CopaQ8CIE6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CopaQ8CIE6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CopaQ8CIE6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CopaQ8CIE6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CopaQ8CIE6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CopaQ8CIE6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CopaQ8CIE6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CopaQ8CIE6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CopaQ8CIE6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CopaQ8CIE6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CopaQ8CIE6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms