Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHW1

Thap1, THAP domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thap1Q8CHW1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Thap1Q8CHW1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Thap1Q8CHW1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Thap1Q8CHW1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Thap1Q8CHW1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Thap1Q8CHW1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Thap1Q8CHW1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thap1Q8CHW1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Thap1Q8CHW1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thap1Q8CHW1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thap1Q8CHW1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thap1Q8CHW1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thap1Q8CHW1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Thap1Q8CHW1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Thap1Q8CHW1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Thap1Q8CHW1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Thap1Q8CHW1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Thap1Q8CHW1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Thap1Q8CHW1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thap1Q8CHW1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Thap1Q8CHW1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Thap1Q8CHW1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Thap1Q8CHW1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Thap1Q8CHW1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Thap1Q8CHW1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Thap1Q8CHW1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Thap1Q8CHW1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Thap1Q8CHW1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Thap1Q8CHW1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Thap1Q8CHW1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thap1Q8CHW1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thap1Q8CHW1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thap1Q8CHW1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thap1Q8CHW1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thap1Q8CHW1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thap1Q8CHW1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thap1Q8CHW1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thap1Q8CHW1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Thap1Q8CHW1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thap1Q8CHW1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thap1Q8CHW1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Thap1Q8CHW1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thap1Q8CHW1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Thap1Q8CHW1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thap1Q8CHW1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thap1Q8CHW1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thap1Q8CHW1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thap1Q8CHW1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thap1Q8CHW1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thap1Q8CHW1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Thap1Q8CHW1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Thap1Q8CHW1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thap1Q8CHW1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thap1Q8CHW1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thap1Q8CHW1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thap1Q8CHW1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thap1Q8CHW1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms