Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEZ1

Smco1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco1Q8CEZ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smco1Q8CEZ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smco1Q8CEZ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smco1Q8CEZ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco1Q8CEZ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco1Q8CEZ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smco1Q8CEZ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smco1Q8CEZ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smco1Q8CEZ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smco1Q8CEZ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smco1Q8CEZ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smco1Q8CEZ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smco1Q8CEZ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smco1Q8CEZ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smco1Q8CEZ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smco1Q8CEZ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco1Q8CEZ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco1Q8CEZ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco1Q8CEZ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smco1Q8CEZ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smco1Q8CEZ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smco1Q8CEZ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smco1Q8CEZ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smco1Q8CEZ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smco1Q8CEZ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smco1Q8CEZ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smco1Q8CEZ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco1Q8CEZ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco1Q8CEZ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco1Q8CEZ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smco1Q8CEZ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smco1Q8CEZ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smco1Q8CEZ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smco1Q8CEZ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smco1Q8CEZ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smco1Q8CEZ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smco1Q8CEZ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco1Q8CEZ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smco1Q8CEZ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smco1Q8CEZ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smco1Q8CEZ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smco1Q8CEZ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smco1Q8CEZ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco1Q8CEZ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco1Q8CEZ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smco1Q8CEZ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco1Q8CEZ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco1Q8CEZ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco1Q8CEZ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smco1Q8CEZ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smco1Q8CEZ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smco1Q8CEZ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smco1Q8CEZ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smco1Q8CEZ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smco1Q8CEZ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smco1Q8CEZ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smco1Q8CEZ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smco1Q8CEZ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smco1Q8CEZ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco1Q8CEZ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco1Q8CEZ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco1Q8CEZ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco1Q8CEZ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smco1Q8CEZ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smco1Q8CEZ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smco1Q8CEZ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms