Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fbxo48Q8CAT8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fbxo48Q8CAT8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fbxo48Q8CAT8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fbxo48Q8CAT8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbxo48Q8CAT8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbxo48Q8CAT8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbxo48Q8CAT8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fbxo48Q8CAT8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbxo48Q8CAT8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbxo48Q8CAT8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Fbxo48Q8CAT8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbxo48Q8CAT8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbxo48Q8CAT8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbxo48Q8CAT8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbxo48Q8CAT8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbxo48Q8CAT8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbxo48Q8CAT8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbxo48Q8CAT8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbxo48Q8CAT8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbxo48Q8CAT8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbxo48Q8CAT8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbxo48Q8CAT8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbxo48Q8CAT8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fbxo48Q8CAT8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fbxo48Q8CAT8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fbxo48Q8CAT8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbxo48Q8CAT8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbxo48Q8CAT8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fbxo48Q8CAT8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fbxo48Q8CAT8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbxo48Q8CAT8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fbxo48Q8CAT8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fbxo48Q8CAT8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbxo48Q8CAT8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbxo48Q8CAT8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbxo48Q8CAT8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbxo48Q8CAT8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fbxo48Q8CAT8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fbxo48Q8CAT8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbxo48Q8CAT8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fbxo48Q8CAT8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbxo48Q8CAT8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbxo48Q8CAT8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbxo48Q8CAT8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fbxo48Q8CAT8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fbxo48Q8CAT8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbxo48Q8CAT8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbxo48Q8CAT8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fbxo48Q8CAT8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fbxo48Q8CAT8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbxo48Q8CAT8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbxo48Q8CAT8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo48Q8CAT8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo48Q8CAT8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo48Q8CAT8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo48Q8CAT8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo48Q8CAT8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo48Q8CAT8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo48Q8CAT8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo48Q8CAT8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo48Q8CAT8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo48Q8CAT8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo48Q8CAT8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo48Q8CAT8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo48Q8CAT8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo48Q8CAT8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo48Q8CAT8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo48Q8CAT8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo48Q8CAT8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms