Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubqln3Q8C5U9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubqln3Q8C5U9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubqln3Q8C5U9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubqln3Q8C5U9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubqln3Q8C5U9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubqln3Q8C5U9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubqln3Q8C5U9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubqln3Q8C5U9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubqln3Q8C5U9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubqln3Q8C5U9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubqln3Q8C5U9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubqln3Q8C5U9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubqln3Q8C5U9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubqln3Q8C5U9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubqln3Q8C5U9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubqln3Q8C5U9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubqln3Q8C5U9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubqln3Q8C5U9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubqln3Q8C5U9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubqln3Q8C5U9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubqln3Q8C5U9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubqln3Q8C5U9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubqln3Q8C5U9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubqln3Q8C5U9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubqln3Q8C5U9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubqln3Q8C5U9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubqln3Q8C5U9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubqln3Q8C5U9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubqln3Q8C5U9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubqln3Q8C5U9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubqln3Q8C5U9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubqln3Q8C5U9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubqln3Q8C5U9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubqln3Q8C5U9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubqln3Q8C5U9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubqln3Q8C5U9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubqln3Q8C5U9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubqln3Q8C5U9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubqln3Q8C5U9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubqln3Q8C5U9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubqln3Q8C5U9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubqln3Q8C5U9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubqln3Q8C5U9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubqln3Q8C5U9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubqln3Q8C5U9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubqln3Q8C5U9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubqln3Q8C5U9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubqln3Q8C5U9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubqln3Q8C5U9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubqln3Q8C5U9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubqln3Q8C5U9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms