Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0T1

Fem1ab, Protein fem-1 homolog A-B, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fem1abQ8C0T1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fem1abQ8C0T1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fem1abQ8C0T1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fem1abQ8C0T1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fem1abQ8C0T1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fem1abQ8C0T1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fem1abQ8C0T1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fem1abQ8C0T1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fem1abQ8C0T1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fem1abQ8C0T1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fem1abQ8C0T1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fem1abQ8C0T1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fem1abQ8C0T1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fem1abQ8C0T1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fem1abQ8C0T1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fem1abQ8C0T1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fem1abQ8C0T1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fem1abQ8C0T1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fem1abQ8C0T1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fem1abQ8C0T1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fem1abQ8C0T1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fem1abQ8C0T1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fem1abQ8C0T1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fem1abQ8C0T1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fem1abQ8C0T1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fem1abQ8C0T1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fem1abQ8C0T1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fem1abQ8C0T1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fem1abQ8C0T1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fem1abQ8C0T1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fem1abQ8C0T1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fem1abQ8C0T1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fem1abQ8C0T1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fem1abQ8C0T1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fem1abQ8C0T1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fem1abQ8C0T1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fem1abQ8C0T1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fem1abQ8C0T1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fem1abQ8C0T1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fem1abQ8C0T1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fem1abQ8C0T1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Fem1abQ8C0T1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fem1abQ8C0T1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fem1abQ8C0T1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fem1abQ8C0T1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fem1abQ8C0T1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fem1abQ8C0T1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fem1abQ8C0T1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fem1abQ8C0T1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fem1abQ8C0T1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fem1abQ8C0T1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fem1abQ8C0T1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fem1abQ8C0T1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fem1abQ8C0T1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fem1abQ8C0T1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fem1abQ8C0T1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fem1abQ8C0T1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fem1abQ8C0T1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fem1abQ8C0T1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fem1abQ8C0T1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fem1abQ8C0T1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fem1abQ8C0T1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fem1abQ8C0T1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms