Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmem87aQ8BXN9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmem87aQ8BXN9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmem87aQ8BXN9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tmem87aQ8BXN9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tmem87aQ8BXN9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmem87aQ8BXN9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmem87aQ8BXN9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmem87aQ8BXN9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmem87aQ8BXN9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmem87aQ8BXN9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmem87aQ8BXN9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmem87aQ8BXN9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmem87aQ8BXN9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmem87aQ8BXN9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmem87aQ8BXN9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tmem87aQ8BXN9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmem87aQ8BXN9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tmem87aQ8BXN9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmem87aQ8BXN9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmem87aQ8BXN9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmem87aQ8BXN9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmem87aQ8BXN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tmem87aQ8BXN9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmem87aQ8BXN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmem87aQ8BXN9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmem87aQ8BXN9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmem87aQ8BXN9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmem87aQ8BXN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmem87aQ8BXN9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmem87aQ8BXN9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmem87aQ8BXN9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmem87aQ8BXN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmem87aQ8BXN9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmem87aQ8BXN9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tmem87aQ8BXN9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tmem87aQ8BXN9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tmem87aQ8BXN9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmem87aQ8BXN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmem87aQ8BXN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmem87aQ8BXN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmem87aQ8BXN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmem87aQ8BXN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmem87aQ8BXN9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmem87aQ8BXN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmem87aQ8BXN9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmem87aQ8BXN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmem87aQ8BXN9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmem87aQ8BXN9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmem87aQ8BXN9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmem87aQ8BXN9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem87aQ8BXN9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmem87aQ8BXN9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem87aQ8BXN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmem87aQ8BXN9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmem87aQ8BXN9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmem87aQ8BXN9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem87aQ8BXN9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem87aQ8BXN9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem87aQ8BXN9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms