Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW11

Prss58, Putative inactive serine protease 58, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss58Q8BW11 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss58Q8BW11 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss58Q8BW11 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss58Q8BW11 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss58Q8BW11 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss58Q8BW11 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss58Q8BW11 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss58Q8BW11 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss58Q8BW11 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss58Q8BW11 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss58Q8BW11 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss58Q8BW11 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss58Q8BW11 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss58Q8BW11 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss58Q8BW11 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss58Q8BW11 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss58Q8BW11 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prss58Q8BW11 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prss58Q8BW11 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prss58Q8BW11 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prss58Q8BW11 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prss58Q8BW11 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prss58Q8BW11 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prss58Q8BW11 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prss58Q8BW11 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prss58Q8BW11 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prss58Q8BW11 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prss58Q8BW11 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss58Q8BW11 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss58Q8BW11 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms