Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Bicd1Q8BR07 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Bicd1Q8BR07 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Bicd1Q8BR07 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bicd1Q8BR07 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bicd1Q8BR07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bicd1Q8BR07 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bicd1Q8BR07 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bicd1Q8BR07 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bicd1Q8BR07 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bicd1Q8BR07 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Bicd1Q8BR07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bicd1Q8BR07 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bicd1Q8BR07 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bicd1Q8BR07 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bicd1Q8BR07 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Bicd1Q8BR07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bicd1Q8BR07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bicd1Q8BR07 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Bicd1Q8BR07 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bicd1Q8BR07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bicd1Q8BR07 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bicd1Q8BR07 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bicd1Q8BR07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bicd1Q8BR07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bicd1Q8BR07 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Bicd1Q8BR07 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Bicd1Q8BR07 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bicd1Q8BR07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bicd1Q8BR07 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bicd1Q8BR07 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bicd1Q8BR07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bicd1Q8BR07 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bicd1Q8BR07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bicd1Q8BR07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bicd1Q8BR07 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bicd1Q8BR07 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bicd1Q8BR07 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bicd1Q8BR07 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bicd1Q8BR07 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bicd1Q8BR07 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Bicd1Q8BR07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bicd1Q8BR07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Bicd1Q8BR07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bicd1Q8BR07 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bicd1Q8BR07 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bicd1Q8BR07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bicd1Q8BR07 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bicd1Q8BR07 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bicd1Q8BR07 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bicd1Q8BR07 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bicd1Q8BR07 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bicd1Q8BR07 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bicd1Q8BR07 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bicd1Q8BR07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bicd1Q8BR07 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bicd1Q8BR07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bicd1Q8BR07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bicd1Q8BR07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Bicd1Q8BR07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Bicd1Q8BR07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bicd1Q8BR07 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bicd1Q8BR07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bicd1Q8BR07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bicd1Q8BR07 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bicd1Q8BR07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bicd1Q8BR07 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bicd1Q8BR07 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bicd1Q8BR07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bicd1Q8BR07 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bicd1Q8BR07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bicd1Q8BR07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bicd1Q8BR07 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bicd1Q8BR07 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bicd1Q8BR07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bicd1Q8BR07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Bicd1Q8BR07 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bicd1Q8BR07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bicd1Q8BR07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bicd1Q8BR07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bicd1Q8BR07 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms