Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIS8

Ccdc126, Coiled-coil domain-containing protein 126, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc126Q8BIS8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc126Q8BIS8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc126Q8BIS8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc126Q8BIS8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc126Q8BIS8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc126Q8BIS8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc126Q8BIS8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc126Q8BIS8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc126Q8BIS8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc126Q8BIS8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc126Q8BIS8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc126Q8BIS8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc126Q8BIS8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc126Q8BIS8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc126Q8BIS8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc126Q8BIS8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc126Q8BIS8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc126Q8BIS8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc126Q8BIS8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc126Q8BIS8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc126Q8BIS8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc126Q8BIS8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc126Q8BIS8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc126Q8BIS8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc126Q8BIS8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc126Q8BIS8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc126Q8BIS8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc126Q8BIS8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc126Q8BIS8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc126Q8BIS8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc126Q8BIS8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc126Q8BIS8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc126Q8BIS8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc126Q8BIS8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc126Q8BIS8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc126Q8BIS8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc126Q8BIS8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc126Q8BIS8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc126Q8BIS8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc126Q8BIS8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc126Q8BIS8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc126Q8BIS8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc126Q8BIS8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.4 ms