Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm9sf4Q8BH24 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tm9sf4Q8BH24 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tm9sf4Q8BH24 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm9sf4Q8BH24 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm9sf4Q8BH24 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm9sf4Q8BH24 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm9sf4Q8BH24 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm9sf4Q8BH24 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm9sf4Q8BH24 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm9sf4Q8BH24 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm9sf4Q8BH24 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm9sf4Q8BH24 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm9sf4Q8BH24 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm9sf4Q8BH24 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf4Q8BH24 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf4Q8BH24 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf4Q8BH24 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm9sf4Q8BH24 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm9sf4Q8BH24 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm9sf4Q8BH24 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm9sf4Q8BH24 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm9sf4Q8BH24 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tm9sf4Q8BH24 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tm9sf4Q8BH24 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf4Q8BH24 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf4Q8BH24 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm9sf4Q8BH24 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm9sf4Q8BH24 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm9sf4Q8BH24 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm9sf4Q8BH24 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf4Q8BH24 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf4Q8BH24 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf4Q8BH24 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf4Q8BH24 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf4Q8BH24 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf4Q8BH24 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm9sf4Q8BH24 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf4Q8BH24 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf4Q8BH24 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm9sf4Q8BH24 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf4Q8BH24 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf4Q8BH24 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf4Q8BH24 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf4Q8BH24 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm9sf4Q8BH24 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf4Q8BH24 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm9sf4Q8BH24 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf4Q8BH24 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf4Q8BH24 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf4Q8BH24 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf4Q8BH24 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm9sf4Q8BH24 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf4Q8BH24 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm9sf4Q8BH24 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm9sf4Q8BH24 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf4Q8BH24 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf4Q8BH24 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf4Q8BH24 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm9sf4Q8BH24 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm9sf4Q8BH24 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf4Q8BH24 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf4Q8BH24 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm9sf4Q8BH24 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf4Q8BH24 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf4Q8BH24 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf4Q8BH24 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf4Q8BH24 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tm9sf4Q8BH24 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf4Q8BH24 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf4Q8BH24 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf4Q8BH24 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf4Q8BH24 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tm9sf4Q8BH24 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf4Q8BH24 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf4Q8BH24 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf4Q8BH24 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tm9sf4Q8BH24 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf4Q8BH24 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms