Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vipas39Q8BGQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vipas39Q8BGQ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Vipas39Q8BGQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vipas39Q8BGQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Vipas39Q8BGQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vipas39Q8BGQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vipas39Q8BGQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vipas39Q8BGQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vipas39Q8BGQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vipas39Q8BGQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vipas39Q8BGQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vipas39Q8BGQ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vipas39Q8BGQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vipas39Q8BGQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vipas39Q8BGQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vipas39Q8BGQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vipas39Q8BGQ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vipas39Q8BGQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vipas39Q8BGQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vipas39Q8BGQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Vipas39Q8BGQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vipas39Q8BGQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vipas39Q8BGQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vipas39Q8BGQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vipas39Q8BGQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vipas39Q8BGQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vipas39Q8BGQ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vipas39Q8BGQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vipas39Q8BGQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vipas39Q8BGQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vipas39Q8BGQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vipas39Q8BGQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vipas39Q8BGQ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Vipas39Q8BGQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vipas39Q8BGQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vipas39Q8BGQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vipas39Q8BGQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vipas39Q8BGQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vipas39Q8BGQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vipas39Q8BGQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vipas39Q8BGQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vipas39Q8BGQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vipas39Q8BGQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vipas39Q8BGQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vipas39Q8BGQ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vipas39Q8BGQ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vipas39Q8BGQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vipas39Q8BGQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Vipas39Q8BGQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vipas39Q8BGQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vipas39Q8BGQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vipas39Q8BGQ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vipas39Q8BGQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vipas39Q8BGQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vipas39Q8BGQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vipas39Q8BGQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vipas39Q8BGQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Vipas39Q8BGQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vipas39Q8BGQ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vipas39Q8BGQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
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