Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Htatsf1Q8BGC0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Htatsf1Q8BGC0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Htatsf1Q8BGC0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Htatsf1Q8BGC0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Htatsf1Q8BGC0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Htatsf1Q8BGC0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Htatsf1Q8BGC0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Htatsf1Q8BGC0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Htatsf1Q8BGC0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Htatsf1Q8BGC0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Htatsf1Q8BGC0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Htatsf1Q8BGC0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Htatsf1Q8BGC0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Htatsf1Q8BGC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Htatsf1Q8BGC0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Htatsf1Q8BGC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Htatsf1Q8BGC0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Htatsf1Q8BGC0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Htatsf1Q8BGC0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Htatsf1Q8BGC0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Htatsf1Q8BGC0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Htatsf1Q8BGC0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Htatsf1Q8BGC0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Htatsf1Q8BGC0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Htatsf1Q8BGC0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Htatsf1Q8BGC0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Htatsf1Q8BGC0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Htatsf1Q8BGC0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Htatsf1Q8BGC0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Htatsf1Q8BGC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Htatsf1Q8BGC0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Htatsf1Q8BGC0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Htatsf1Q8BGC0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Htatsf1Q8BGC0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Htatsf1Q8BGC0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Htatsf1Q8BGC0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Htatsf1Q8BGC0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Htatsf1Q8BGC0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Htatsf1Q8BGC0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Htatsf1Q8BGC0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Htatsf1Q8BGC0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Htatsf1Q8BGC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Htatsf1Q8BGC0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Htatsf1Q8BGC0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Htatsf1Q8BGC0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Htatsf1Q8BGC0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Htatsf1Q8BGC0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Htatsf1Q8BGC0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Htatsf1Q8BGC0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Htatsf1Q8BGC0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Htatsf1Q8BGC0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Htatsf1Q8BGC0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Htatsf1Q8BGC0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Htatsf1Q8BGC0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Htatsf1Q8BGC0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Htatsf1Q8BGC0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Htatsf1Q8BGC0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Htatsf1Q8BGC0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Htatsf1Q8BGC0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Htatsf1Q8BGC0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Htatsf1Q8BGC0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Htatsf1Q8BGC0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Htatsf1Q8BGC0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Htatsf1Q8BGC0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Htatsf1Q8BGC0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Htatsf1Q8BGC0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Htatsf1Q8BGC0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Htatsf1Q8BGC0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Htatsf1Q8BGC0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms