Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ChfrQ810L3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChfrQ810L3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChfrQ810L3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ChfrQ810L3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ChfrQ810L3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ChfrQ810L3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ChfrQ810L3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ChfrQ810L3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ChfrQ810L3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChfrQ810L3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChfrQ810L3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChfrQ810L3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ChfrQ810L3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChfrQ810L3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChfrQ810L3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ChfrQ810L3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChfrQ810L3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChfrQ810L3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChfrQ810L3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChfrQ810L3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ChfrQ810L3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChfrQ810L3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChfrQ810L3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChfrQ810L3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChfrQ810L3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChfrQ810L3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChfrQ810L3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChfrQ810L3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChfrQ810L3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChfrQ810L3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ChfrQ810L3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ChfrQ810L3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChfrQ810L3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChfrQ810L3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ChfrQ810L3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChfrQ810L3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChfrQ810L3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChfrQ810L3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChfrQ810L3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ChfrQ810L3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChfrQ810L3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChfrQ810L3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChfrQ810L3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ChfrQ810L3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ChfrQ810L3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChfrQ810L3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChfrQ810L3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChfrQ810L3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ChfrQ810L3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChfrQ810L3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChfrQ810L3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ChfrQ810L3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChfrQ810L3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChfrQ810L3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChfrQ810L3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChfrQ810L3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChfrQ810L3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChfrQ810L3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChfrQ810L3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChfrQ810L3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChfrQ810L3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChfrQ810L3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChfrQ810L3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChfrQ810L3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChfrQ810L3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChfrQ810L3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChfrQ810L3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ChfrQ810L3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChfrQ810L3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChfrQ810L3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChfrQ810L3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ChfrQ810L3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChfrQ810L3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChfrQ810L3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChfrQ810L3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChfrQ810L3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChfrQ810L3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChfrQ810L3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChfrQ810L3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChfrQ810L3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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