Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsg4Q7TMD7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsg4Q7TMD7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsg4Q7TMD7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsg4Q7TMD7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsg4Q7TMD7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dsg4Q7TMD7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsg4Q7TMD7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsg4Q7TMD7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Dsg4Q7TMD7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Dsg4Q7TMD7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dsg4Q7TMD7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dsg4Q7TMD7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Dsg4Q7TMD7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dsg4Q7TMD7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dsg4Q7TMD7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dsg4Q7TMD7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dsg4Q7TMD7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dsg4Q7TMD7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dsg4Q7TMD7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dsg4Q7TMD7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dsg4Q7TMD7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dsg4Q7TMD7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dsg4Q7TMD7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dsg4Q7TMD7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Dsg4Q7TMD7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dsg4Q7TMD7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Dsg4Q7TMD7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dsg4Q7TMD7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dsg4Q7TMD7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg4Q7TMD7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dsg4Q7TMD7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dsg4Q7TMD7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg4Q7TMD7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg4Q7TMD7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg4Q7TMD7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsg4Q7TMD7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg4Q7TMD7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg4Q7TMD7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsg4Q7TMD7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dsg4Q7TMD7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dsg4Q7TMD7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsg4Q7TMD7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dsg4Q7TMD7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dsg4Q7TMD7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dsg4Q7TMD7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg4Q7TMD7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg4Q7TMD7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dsg4Q7TMD7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg4Q7TMD7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dsg4Q7TMD7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dsg4Q7TMD7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dsg4Q7TMD7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg4Q7TMD7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg4Q7TMD7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg4Q7TMD7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg4Q7TMD7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg4Q7TMD7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg4Q7TMD7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dsg4Q7TMD7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsg4Q7TMD7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms