Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc88cQ6VGS5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc88cQ6VGS5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc88cQ6VGS5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc88cQ6VGS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc88cQ6VGS5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc88cQ6VGS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc88cQ6VGS5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc88cQ6VGS5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc88cQ6VGS5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc88cQ6VGS5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc88cQ6VGS5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc88cQ6VGS5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc88cQ6VGS5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc88cQ6VGS5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc88cQ6VGS5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc88cQ6VGS5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc88cQ6VGS5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc88cQ6VGS5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc88cQ6VGS5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc88cQ6VGS5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc88cQ6VGS5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc88cQ6VGS5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc88cQ6VGS5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms