Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna2d2Q6PHS9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna2d2Q6PHS9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna2d2Q6PHS9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna2d2Q6PHS9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna2d2Q6PHS9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cacna2d2Q6PHS9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna2d2Q6PHS9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna2d2Q6PHS9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna2d2Q6PHS9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna2d2Q6PHS9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna2d2Q6PHS9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna2d2Q6PHS9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna2d2Q6PHS9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna2d2Q6PHS9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna2d2Q6PHS9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacna2d2Q6PHS9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna2d2Q6PHS9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna2d2Q6PHS9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna2d2Q6PHS9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna2d2Q6PHS9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna2d2Q6PHS9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna2d2Q6PHS9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna2d2Q6PHS9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cacna2d2Q6PHS9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna2d2Q6PHS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna2d2Q6PHS9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna2d2Q6PHS9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna2d2Q6PHS9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna2d2Q6PHS9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna2d2Q6PHS9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna2d2Q6PHS9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacna2d2Q6PHS9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna2d2Q6PHS9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d2Q6PHS9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d2Q6PHS9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d2Q6PHS9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna2d2Q6PHS9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna2d2Q6PHS9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna2d2Q6PHS9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna2d2Q6PHS9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna2d2Q6PHS9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna2d2Q6PHS9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d2Q6PHS9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d2Q6PHS9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna2d2Q6PHS9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna2d2Q6PHS9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna2d2Q6PHS9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna2d2Q6PHS9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacna2d2Q6PHS9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna2d2Q6PHS9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d2Q6PHS9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d2Q6PHS9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna2d2Q6PHS9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna2d2Q6PHS9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d2Q6PHS9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d2Q6PHS9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna2d2Q6PHS9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d2Q6PHS9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d2Q6PHS9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d2Q6PHS9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna2d2Q6PHS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna2d2Q6PHS9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna2d2Q6PHS9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna2d2Q6PHS9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna2d2Q6PHS9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna2d2Q6PHS9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms