Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Snx13Q6PHS6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,45■■■□□ 2,3
Snx13Q6PHS6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Snx13Q6PHS6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Snx13Q6PHS6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Snx13Q6PHS6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Snx13Q6PHS6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Snx13Q6PHS6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Snx13Q6PHS6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Snx13Q6PHS6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Snx13Q6PHS6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Snx13Q6PHS6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Snx13Q6PHS6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Snx13Q6PHS6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Snx13Q6PHS6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Snx13Q6PHS6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Snx13Q6PHS6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Snx13Q6PHS6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Snx13Q6PHS6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Snx13Q6PHS6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Snx13Q6PHS6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Snx13Q6PHS6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Snx13Q6PHS6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Snx13Q6PHS6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Snx13Q6PHS6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Snx13Q6PHS6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Snx13Q6PHS6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Snx13Q6PHS6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Snx13Q6PHS6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Snx13Q6PHS6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Snx13Q6PHS6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Snx13Q6PHS6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Snx13Q6PHS6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Snx13Q6PHS6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Snx13Q6PHS6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Snx13Q6PHS6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Snx13Q6PHS6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Snx13Q6PHS6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Snx13Q6PHS6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Snx13Q6PHS6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Snx13Q6PHS6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Snx13Q6PHS6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Snx13Q6PHS6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Snx13Q6PHS6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Snx13Q6PHS6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Snx13Q6PHS6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Snx13Q6PHS6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Snx13Q6PHS6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Snx13Q6PHS6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Snx13Q6PHS6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Snx13Q6PHS6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Snx13Q6PHS6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Snx13Q6PHS6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Snx13Q6PHS6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Snx13Q6PHS6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Snx13Q6PHS6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Snx13Q6PHS6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Snx13Q6PHS6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Snx13Q6PHS6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,7 ms