Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc57Q6PHN1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc57Q6PHN1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc57Q6PHN1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc57Q6PHN1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc57Q6PHN1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc57Q6PHN1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc57Q6PHN1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc57Q6PHN1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc57Q6PHN1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc57Q6PHN1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc57Q6PHN1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc57Q6PHN1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc57Q6PHN1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc57Q6PHN1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc57Q6PHN1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc57Q6PHN1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc57Q6PHN1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc57Q6PHN1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc57Q6PHN1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc57Q6PHN1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc57Q6PHN1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc57Q6PHN1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc57Q6PHN1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc57Q6PHN1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc57Q6PHN1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc57Q6PHN1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc57Q6PHN1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc57Q6PHN1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc57Q6PHN1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc57Q6PHN1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc57Q6PHN1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc57Q6PHN1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc57Q6PHN1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc57Q6PHN1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc57Q6PHN1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc57Q6PHN1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc57Q6PHN1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc57Q6PHN1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc57Q6PHN1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc57Q6PHN1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc57Q6PHN1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc57Q6PHN1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc57Q6PHN1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc57Q6PHN1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc57Q6PHN1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc57Q6PHN1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc57Q6PHN1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc57Q6PHN1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc57Q6PHN1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc57Q6PHN1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms