Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HjurpQ6PG16 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HjurpQ6PG16 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HjurpQ6PG16 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HjurpQ6PG16 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HjurpQ6PG16 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HjurpQ6PG16 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HjurpQ6PG16 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HjurpQ6PG16 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HjurpQ6PG16 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HjurpQ6PG16 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HjurpQ6PG16 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HjurpQ6PG16 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HjurpQ6PG16 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HjurpQ6PG16 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HjurpQ6PG16 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HjurpQ6PG16 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HjurpQ6PG16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HjurpQ6PG16 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HjurpQ6PG16 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HjurpQ6PG16 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HjurpQ6PG16 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HjurpQ6PG16 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HjurpQ6PG16 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HjurpQ6PG16 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HjurpQ6PG16 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HjurpQ6PG16 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HjurpQ6PG16 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HjurpQ6PG16 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HjurpQ6PG16 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HjurpQ6PG16 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HjurpQ6PG16 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HjurpQ6PG16 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HjurpQ6PG16 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HjurpQ6PG16 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HjurpQ6PG16 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HjurpQ6PG16 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HjurpQ6PG16 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HjurpQ6PG16 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HjurpQ6PG16 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HjurpQ6PG16 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HjurpQ6PG16 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HjurpQ6PG16 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HjurpQ6PG16 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HjurpQ6PG16 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HjurpQ6PG16 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HjurpQ6PG16 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HjurpQ6PG16 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HjurpQ6PG16 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HjurpQ6PG16 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HjurpQ6PG16 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HjurpQ6PG16 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HjurpQ6PG16 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HjurpQ6PG16 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HjurpQ6PG16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HjurpQ6PG16 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HjurpQ6PG16 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HjurpQ6PG16 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HjurpQ6PG16 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HjurpQ6PG16 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HjurpQ6PG16 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HjurpQ6PG16 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HjurpQ6PG16 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HjurpQ6PG16 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HjurpQ6PG16 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HjurpQ6PG16 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HjurpQ6PG16 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HjurpQ6PG16 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HjurpQ6PG16 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HjurpQ6PG16 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HjurpQ6PG16 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HjurpQ6PG16 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HjurpQ6PG16 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HjurpQ6PG16 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HjurpQ6PG16 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HjurpQ6PG16 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HjurpQ6PG16 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HjurpQ6PG16 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HjurpQ6PG16 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms