Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3c3Q6PF93 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3c3Q6PF93 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c3Q6PF93 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c3Q6PF93 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3c3Q6PF93 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c3Q6PF93 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c3Q6PF93 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c3Q6PF93 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c3Q6PF93 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c3Q6PF93 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c3Q6PF93 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c3Q6PF93 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3c3Q6PF93 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pik3c3Q6PF93 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pik3c3Q6PF93 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pik3c3Q6PF93 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pik3c3Q6PF93 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pik3c3Q6PF93 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pik3c3Q6PF93 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pik3c3Q6PF93 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pik3c3Q6PF93 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pik3c3Q6PF93 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pik3c3Q6PF93 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pik3c3Q6PF93 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pik3c3Q6PF93 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pik3c3Q6PF93 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pik3c3Q6PF93 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pik3c3Q6PF93 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pik3c3Q6PF93 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pik3c3Q6PF93 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pik3c3Q6PF93 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pik3c3Q6PF93 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pik3c3Q6PF93 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pik3c3Q6PF93 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pik3c3Q6PF93 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pik3c3Q6PF93 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pik3c3Q6PF93 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pik3c3Q6PF93 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pik3c3Q6PF93 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pik3c3Q6PF93 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pik3c3Q6PF93 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pik3c3Q6PF93 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pik3c3Q6PF93 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pik3c3Q6PF93 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pik3c3Q6PF93 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3c3Q6PF93 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3c3Q6PF93 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3c3Q6PF93 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pik3c3Q6PF93 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pik3c3Q6PF93 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pik3c3Q6PF93 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pik3c3Q6PF93 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pik3c3Q6PF93 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pik3c3Q6PF93 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pik3c3Q6PF93 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pik3c3Q6PF93 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pik3c3Q6PF93 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms