Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Trak2Q6P9N8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Trak2Q6P9N8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Trak2Q6P9N8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Trak2Q6P9N8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Trak2Q6P9N8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Trak2Q6P9N8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Trak2Q6P9N8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Trak2Q6P9N8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Trak2Q6P9N8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Trak2Q6P9N8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Trak2Q6P9N8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Trak2Q6P9N8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Trak2Q6P9N8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Trak2Q6P9N8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Trak2Q6P9N8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Trak2Q6P9N8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Trak2Q6P9N8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Trak2Q6P9N8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Trak2Q6P9N8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Trak2Q6P9N8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Trak2Q6P9N8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Trak2Q6P9N8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Trak2Q6P9N8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Trak2Q6P9N8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Trak2Q6P9N8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Trak2Q6P9N8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Trak2Q6P9N8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Trak2Q6P9N8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Trak2Q6P9N8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Trak2Q6P9N8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Trak2Q6P9N8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Trak2Q6P9N8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Trak2Q6P9N8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Trak2Q6P9N8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Trak2Q6P9N8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Trak2Q6P9N8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Trak2Q6P9N8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Trak2Q6P9N8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Trak2Q6P9N8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Trak2Q6P9N8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Trak2Q6P9N8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Trak2Q6P9N8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Trak2Q6P9N8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Trak2Q6P9N8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Trak2Q6P9N8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Trak2Q6P9N8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Trak2Q6P9N8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trak2Q6P9N8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Trak2Q6P9N8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Trak2Q6P9N8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Trak2Q6P9N8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Trak2Q6P9N8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Trak2Q6P9N8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Trak2Q6P9N8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Trak2Q6P9N8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Trak2Q6P9N8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Trak2Q6P9N8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Trak2Q6P9N8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Trak2Q6P9N8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Trak2Q6P9N8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Trak2Q6P9N8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trak2Q6P9N8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trak2Q6P9N8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trak2Q6P9N8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trak2Q6P9N8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Trak2Q6P9N8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Trak2Q6P9N8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Trak2Q6P9N8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trak2Q6P9N8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Trak2Q6P9N8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Trak2Q6P9N8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Trak2Q6P9N8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Trak2Q6P9N8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Trak2Q6P9N8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Trak2Q6P9N8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Trak2Q6P9N8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Trak2Q6P9N8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Trak2Q6P9N8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Trak2Q6P9N8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Trak2Q6P9N8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Trak2Q6P9N8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Trak2Q6P9N8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trak2Q6P9N8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Trak2Q6P9N8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Trak2Q6P9N8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Trak2Q6P9N8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Trak2Q6P9N8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Trak2Q6P9N8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Trak2Q6P9N8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Trak2Q6P9N8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Trak2Q6P9N8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Trak2Q6P9N8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Trak2Q6P9N8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Trak2Q6P9N8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Trak2Q6P9N8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Trak2Q6P9N8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Trak2Q6P9N8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Trak2Q6P9N8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Trak2Q6P9N8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,9 ms